Trombino tipo fermento agapurino subvienetų išskyrimas iš Agkistrodon halys nuodų ir aminorūgščių liekanų sekos nustatymas

[Santrauka] Tikslas Nustatyti dviejų panašių Agacutin subvienetų N-galo 15 aminorūgščių liekanas.Du fermento molekulės subvienetai turi būti padalyti, kad būtų gauta subvieneto viena peptidinė grandinė, ir sekvenuoti.Metodai Labai išgrynintas agakutinas buvo gautas biocheminiu metodu.Vieno subvieneto mėginiai identifikavimui ir sekos nustatymui buvo paruošti naudojant SDS-PAGE elektroforezės atskyrimą, subvieneto lipnios juostelės atgavimą ir PVDF membranos elektrotransferos technologiją.Pastarasis Edmano degradacijos metodu nustatė 15 aminorūgščių liekanų subvieneto N-gale.Rezultatai Didelio subvieneto (16 kDa) seka buvo DCSSGWSSYEEHQYY, o mažo subvieneto (15 kDa) seka buvo DSSGWSSYEGHEYYV.Išvada Atlikus paiešką NCBI duomenų bazėje, sekvenavimo rezultatai parodė, kad Agacutin buvo naujas gyvatės nuodų trombino tipo fermentas.